Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.245e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.155e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.025e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.825e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.85e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.335e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 TSC22D4-205ENST00000493217 2060 ntTSL 1 (best)22.13■■□□□ 1.135e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.085e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-210ENST00000494766 1003 ntTSL 221.74■■□□□ 1.075e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 PPP1CA-210ENST00000542876 588 ntTSL 320.32■□□□□ 0.845e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 MRPL51-204ENST00000540949 343 ntTSL 219.84■□□□□ 0.775e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.685e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.665e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 PPP1CA-211ENST00000546202 554 ntTSL 418.51■□□□□ 0.555e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 PPP1CA-209ENST00000537694 882 ntTSL 517.92■□□□□ 0.465e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.255e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.235e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.25e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.165e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.075e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-201ENST00000252457 2034 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.335e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-205ENST00000375308 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.335e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 PPP1CA-206ENST00000529724 572 ntTSL 212.76□□□□□ -0.375e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 PPP1CA-205ENST00000527663 765 ntTSL 312.11□□□□□ -0.475e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.395e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.75e-10■□□□□ 9
FTOQ9C0B1 TMEM214-213ENST00000495312 804 ntTSL 231.61■■■□□ 2.653e-11■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 223.75■■□□□ 1.393e-11■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.193e-11■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.993e-11■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM214-212ENST00000478980 572 ntTSL 210.44□□□□□ -0.743e-11■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-12■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.624e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.094e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.954e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.74e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.684e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.364e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.234e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PCSK6-203ENST00000557794 1196 ntTSL 512.7□□□□□ -0.384e-8■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.885e-12■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.615e-12■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 BLVRA-204ENST00000453612 757 ntTSL 221.04■□□□□ 0.965e-12■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 BLVRA-203ENST00000424330 443 ntTSL 317.22■□□□□ 0.355e-12■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.345e-12■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.115e-12■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-214ENST00000480194 455 ntTSL 519.64■□□□□ 0.734e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 418.83■□□□□ 0.64e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.344e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-219ENST00000492297 559 ntTSL 217.2■□□□□ 0.344e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.314e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)16.97■□□□□ 0.314e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 316.78■□□□□ 0.284e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.264e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-218ENST00000491103 871 ntTSL 516.49■□□□□ 0.234e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.214e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.24e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.054e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -04e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 414.32□□□□□ -0.124e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 412.61□□□□□ -0.394e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 216.98■□□□□ 0.311e-15■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.31e-15■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 PDIA3-206ENST00000497349 739 ntTSL 25.34□□□□□ -1.551e-15■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 KHNYN-205ENST00000556510 911 ntTSL 225.36■■□□□ 1.652e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 523.47■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.022e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-205ENST00000423935 614 ntTSL 221.22■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.912e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.881e-7■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 318.19■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.42e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.385e-13■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-13■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 515.8■□□□□ 0.122e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.12e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-211ENST00000636247 3725 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.042e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.032e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 212.53□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 MYH10-202ENST00000360416 7762 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 MYH10-210ENST00000488329 538 ntTSL 211.91□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 23.93□□□□□ -1.782e-6■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.842e-16■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.232e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.092e-14■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 LSS-206ENST00000464357 1041 ntTSL 523.52■■□□□ 1.366e-10■□□□□ 8.9
FTOQ9C0B1 MVD-203ENST00000562651 908 ntTSL 223.04■■□□□ 1.282e-14■□□□□ 8.9
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