Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms