Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HIGD2AQ9BW72 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms