Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDF4Q9BRK5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDF4Q9BRK5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms