Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC77Q9BR77 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms