Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHP1Q99653 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHP1Q99653 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms