Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GBP4Q96PP9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GBP4Q96PP9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms