Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E2Q96LR5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBE2E2Q96LR5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms