Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms