Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TMEM86B-202ENST00000585416 2034 nt19.08■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT22-210ENST00000543358 659 ntTSL 319.07■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CCM2-216ENST00000488727 1719 ntTSL 519.01■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DLD-211ENST00000485066 483 ntTSL 519■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ECSIT-212ENST00000592571 941 ntTSL 218.99■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 218.97■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SPATA13-209ENST00000466831 2191 ntTSL 218.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CTNNBL1-205ENST00000447935 778 ntTSL 518.91■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-207ENST00000420369 780 ntTSL 318.9■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MZT2B-206ENST00000480182 480 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.615e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX14-217ENST00000514419 863 ntTSL 318.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-216ENST00000532456 664 ntTSL 418.83■□□□□ 0.64e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-218ENST00000567606 2042 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-211ENST00000572044 563 ntTSL 418.78■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EHMT1-207ENST00000472849 708 ntTSL 318.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RABGAP1-201ENST00000317419 2186 ntTSL 318.74■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SETD3-206ENST00000453764 973 ntTSL 518.72■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 KDM4A-202ENST00000463151 1023 ntTSL 518.72■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMTA1-209ENST00000476163 863 ntTSL 218.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MPP6-205ENST00000430180 1191 ntTSL 518.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1R1-204ENST00000573095 828 ntTSL 318.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PSEN2-209ENST00000521431 730 ntTSL 318.69■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-220ENST00000511663 966 ntTSL 518.68■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 ARHGEF18-203ENST00000594665 4616 ntTSL 218.68■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 518.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 318.67■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT9-202ENST00000440591 951 ntTSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-207ENST00000425813 945 ntTSL 518.66■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLCD3-209ENST00000611986 591 ntTSL 518.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT22-202ENST00000422364 2055 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-209ENST00000436778 802 ntTSL 318.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SYNE3-204ENST00000555759 5493 ntTSL 218.53■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 318.52■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CSK-213ENST00000569462 534 ntTSL 418.51■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WDR18-209ENST00000591985 1498 ntTSL 518.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT22-208ENST00000537707 986 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PIPOX-210ENST00000583215 1829 ntTSL 518.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MNT-206ENST00000574559 580 ntTSL 418.41■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TAF6L-204ENST00000526261 419 ntTSL 518.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STAU2-208ENST00000520872 560 ntTSL 318.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 JUP-212ENST00000591690 583 ntTSL 318.39■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBXN7-206ENST00000493566 921 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHYKPL-210ENST00000493197 1969 ntTSL 218.37■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NIT2-202ENST00000460317 648 ntTSL 318.35■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PTBP2-209ENST00000482253 2029 ntTSL 218.29■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ZCCHC2-210ENST00000591632 608 ntTSL 318.26■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-218ENST00000511185 1071 ntTSL 218.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 54.9
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