Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NKD1Q969G9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NKD1Q969G9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms