Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW36

ZCCHC13, Zinc finger CCHC domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC13Q8WW36 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ZCCHC13Q8WW36 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZCCHC13Q8WW36 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms