Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms