Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIK3C3Q8NEB9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3C3Q8NEB9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms