Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC8AQ8IWT6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8AQ8IWT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms