Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN1Q6NZI2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms