Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LEMD1Q68G75 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LEMD1Q68G75 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms