Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM78BQ5VT40 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM78BQ5VT40 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms