Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
FRMPD1Q5SYB0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms