Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms