Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF212Q495C1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms