Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL24A1Q17RW2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL24A1Q17RW2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms