Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPAQ15257 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms