Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
R3HDM1Q15032 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
R3HDM1Q15032 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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