Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 BRD9-201ENST00000466684 1417 ntTSL 217.86■□□□□ 0.454e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 BRD9-212ENST00000495265 2843 ntTSL 216.88■□□□□ 0.294e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 BRD9-208ENST00000489816 3170 ntTSL 1 (best)14.98□□□□□ -0.014e-7■■□□□ 11.6
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PUM1Q14671 BRD9-209ENST00000490814 3477 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.884e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 11.6
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PUM1Q14671 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.622e-10■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 CCDC124-202ENST00000596123 580 ntTSL 213.74□□□□□ -0.212e-10■■□□□ 11.6
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PUM1Q14671 HSPA8-209ENST00000526862 504 ntTSL 34.86□□□□□ -1.633e-8■■□□□ 11.6
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PUM1Q14671 CARS-209ENST00000470221 2466 ntTSL 216.72■□□□□ 0.274e-15■■□□□ 11.6
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PUM1Q14671 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.545e-7■■□□□ 11.6
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PUM1Q14671 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.83e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 RPS4X-202ENST00000373626 594 ntTSL 37.94□□□□□ -1.146e-18■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-7■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 421.39■■□□□ 1.014e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 521.35■■□□□ 1.014e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 420.24■□□□□ 0.834e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-218ENST00000451058 418 ntTSL 319.82■□□□□ 0.764e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 319.09■□□□□ 0.654e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-221ENST00000473028 556 ntTSL 418.26■□□□□ 0.514e-9■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 MED15-216ENST00000445189 596 ntTSL 418.09■□□□□ 0.494e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-207ENST00000423862 581 ntTSL 317.97■□□□□ 0.474e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 317.76■□□□□ 0.434e-9■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 316.93■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-217ENST00000445987 590 ntTSL 416.88■□□□□ 0.294e-9■■□□□ 11.5
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PUM1Q14671 MED15-228ENST00000487550 587 ntTSL 316.75■□□□□ 0.274e-9■■□□□ 11.5
PUM1Q14671 MED15-209ENST00000428629 572 ntTSL 48.4□□□□□ -1.064e-9■■□□□ 11.5
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