Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APOFQ13790 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOFQ13790 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOFQ13790 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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