Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TMED1Q13445 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TMED1Q13445 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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