Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK5R2Q13319 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5R2Q13319 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5R2Q13319 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5R2Q13319 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK5R2Q13319 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms