Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANK3Q12955 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms