Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 C19orf48-209ENST00000597705 892 ntTSL 312.6□□□□□ -0.395e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.415e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-208ENST00000597493 971 ntTSL 212.3□□□□□ -0.445e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-213ENST00000601267 782 ntTSL 212.25□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.465e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 COMMD10-204ENST00000507356 870 ntTSL 311.94□□□□□ -0.55e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 C19orf48-211ENST00000599004 866 ntTSL 511.91□□□□□ -0.55e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 CERS5-205ENST00000542320 951 ntTSL 211.71□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 20
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ILF3Q12906 C19orf48-204ENST00000595794 941 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 20
ILF3Q12906 CNOT10-207ENST00000455381 770 ntTSL 510.4□□□□□ -0.745e-6■■■■□ 20
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ILF3Q12906 DDX50-203ENST00000466265 744 ntTSL 37.26□□□□□ -1.255e-6■■■■□ 20
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ILF3Q12906 RSL1D1-203ENST00000570767 871 ntTSL 55.12□□□□□ -1.599e-7■■■■□ 20
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ILF3Q12906 PGPEP1-202ENST00000269919 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.666e-7■■■■□ 20
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ILF3Q12906 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.052e-9■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.748e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.698e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.558e-7■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 AFF1-205ENST00000504956 1668 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.733e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 AFF1-207ENST00000511442 463 ntTSL 32.15□□□□□ -2.073e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 519.55■□□□□ 0.723e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-208ENST00000456640 706 ntTSL 517.04■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.243e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.393e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.287e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-204ENST00000562084 1864 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.356e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-213ENST00000567279 1876 ntTSL 211.28□□□□□ -0.66e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-205ENST00000562219 1004 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.766e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-202ENST00000395205 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.876e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-210ENST00000566400 2055 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.026e-8■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 BBS4-201ENST00000268057 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.166e-8■■■■□ 19.9
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