Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
STX4Q12846 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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STX4Q12846 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
STX4Q12846 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
STX4Q12846 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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