Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C2orf54Q08AI8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C2orf54Q08AI8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms