Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4DQ08499 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms