Protein–RNA interactions for Protein: Q04670

TY1B-MR2, Transposon Ty1-MR2 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-MR2Q04670 PFK27YOL136C 1194 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YDR338CYDR338C 2088 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 COX1Q0045 1605 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YCR015CYCR015C 954 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YFR056CYFR056C 369 nt0.5□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 SPO12YHR152W 522 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 DGR2YKL121W 2559 nt0.49□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 SPO77YLR341W 1434 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 RRG1YDR065W 1098 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 NME1NME1 340 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 HIR3YJR140C 4947 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 CSE1YGL238W 2883 nt0.48□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 RPL40AYIL148W 387 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YBR063CYBR063C 1215 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 CDC27YBL084C 2277 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 AZF1YOR113W 2745 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 RGI1YER067W 486 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YGL118CYGL118C 438 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YNL010WYNL010W 726 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YNL179CYNL179C 438 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 MUK1YPL070W 1839 nt0.47□□□□□ -2.33
TY1B-MR2Q04670 YGR250CYGR250C 2346 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 ALK1YGL021W 2283 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YGL138CYGL138C 1038 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 RIF2YLR453C 1188 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 LSM7YNL147W 348 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 RPS10AYOR293W 318 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YML002WYML002W 2214 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 MVP1YMR004W 1536 nt0.46□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YGR114CYGR114C 390 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 FYV4YHR059W 393 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 SPP381YBR152W 876 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 DSE1YER124C 1722 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YDR042CYDR042C 603 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 UFE1YOR075W 1041 nt0.45□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 NCA2YPR155C 1851 nt0.44□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 CDC5YMR001C 2118 nt0.44□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 CYB5YNL111C 363 nt0.43□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 UPF3YGR072W 1164 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YIP1YGR172C 747 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 CMC2YBL059C-A 330 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 FIG1YBR040W 897 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 SRB4YER022W 2064 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 MYO1YHR023W 5787 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 WAR1YML076C 2835 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 MER1YNL210W 813 nt0.42□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.41□□□□□ -2.34
TY1B-MR2Q04670 SMD1YGR074W 441 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 LYS14YDR034C 2373 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 YDR286CYDR286C 345 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 YMR178WYMR178W 825 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 ADF1YCL058W-A 342 nt0.4□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 BNS1YGR230W 414 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 RAM2YKL019W 951 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 RPL38YLR325C 237 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 MGR1YCL044C 1254 nt0.39□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 snR68snR68 136 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 ARL3YPL051W 597 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 YLL007CYLL007C 1998 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 NUT1YGL151W 3399 nt0.38□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 YGL039WYGL039W 1047 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 NUP120YKL057C 3114 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 snR45snR45 172 nt0.37□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 PRS3YHL011C 963 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 SVP26YHR181W 687 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 snR35snR35 204 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 YLL054CYLL054C 2532 nt0.36□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 PRM8YGL053W 714 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 EDC1YGL222C 528 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 YIL012WYIL012W 342 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 HYR1YIR037W 492 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 ABM1YJR108W 372 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 CIN2YPL241C 807 nt0.35□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 SNA4YDL123W 423 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 SMB1YER029C 591 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 YIM2YMR151W 438 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 SMY1YKL079W 1971 nt0.34□□□□□ -2.35
TY1B-MR2Q04670 PCL2YDL127W 927 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 SLU7YDR088C 1149 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 YFR054CYFR054C 579 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 SEC22YLR268W 645 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 YBL094CYBL094C 333 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 RPB5YBR154C 648 nt0.34□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 YDR248CYDR248C 582 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 HOP2YGL033W 657 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 IRC14YOR135C 342 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 UAF30YOR295W 687 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 NUP188YML103C 4968 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 AIM9YER080W 1884 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 STB6YKL072W 2301 nt0.33□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 PSO2YMR137C 1986 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 ECM12YHR021W-A 456 nt0.32□□□□□ -2.36
TY1B-MR2Q04670 REX3YLR107W 1215 nt0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms