Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RPS28P62857 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RPS28P62857 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RPS28P62857 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RPS28P62857 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPS28P62857 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms