Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MKI67P46013 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MKI67P46013 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MKI67P46013 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKI67P46013 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKI67P46013 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MKI67P46013 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MKI67P46013 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MKI67P46013 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms