Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNCAP37840 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNCAP37840 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNCAP37840 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNCAP37840 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNCAP37840 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNCAP37840 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SNCAP37840 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms