Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ZEB1P37275 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ZEB1P37275 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms