Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC1P33527 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms