Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 NCL1YBL024W 2055 nt2.25□□□□□ -2.05
SPB1P25582 MCD1YDL003W 1701 nt2.25□□□□□ -2.05
SPB1P25582 NAB6YML117W 3405 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 VAR1Q0140 1197 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 ECL1YGR146C 636 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 AIM29YKR074W 468 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YLR031WYLR031W 561 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 LSM7YNL147W 348 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 snR54snR54 86 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 RNH70YGR276C 1662 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YJL016WYJL016W 1686 nt2.24□□□□□ -2.05
SPB1P25582 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 NCE101YJL205C 162 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 IRC19YLL033W 693 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YOR248WYOR248W 303 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 snR41snR41 95 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 SCP160YJL080C 3669 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 VTC3YPL019C 2508 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 NAN1YPL126W 2691 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 RGA1YOR127W 3024 nt2.23□□□□□ -2.05
SPB1P25582 MPH1YIR002C 2982 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YDR250CYDR250C 276 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 RPL27BYDR471W 411 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 MZM1YDR493W 372 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YHR125WYHR125W 306 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 YJR157WYJR157W 363 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 RUF22RUF22 515 nt2.22□□□□□ -2.05
SPB1P25582 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 PPN1YDR452W 2025 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 GET1YGL020C 708 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YNL010WYNL010W 726 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 ROX1YPR065W 1107 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 RPB5YBR154C 648 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 SEC16YPL085W 6588 nt2.21□□□□□ -2.06
SPB1P25582 SAP185YJL098W 3177 nt2.2□□□□□ -2.06
SPB1P25582 TAE2YPL009C 3117 nt2.2□□□□□ -2.06
SPB1P25582 INO80YGL150C 4470 nt2.2□□□□□ -2.06
SPB1P25582 IPT1YDR072C 1584 nt2.2□□□□□ -2.06
SPB1P25582 AYR1YIL124W 894 nt2.2□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YLR269CYLR269C 351 nt2.2□□□□□ -2.06
SPB1P25582 TFC3YAL001C 3483 nt2.2□□□□□ -2.06
SPB1P25582 IST2YBR086C 2841 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 SSD1YDR293C 3753 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 VOA1YGR106C 798 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 PSY1YKL076C 384 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YAR068WYAR068W 486 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 GRX8YLR364W 330 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 TSC3YBR058C-A 243 nt2.19□□□□□ -2.06
SPB1P25582 APL5YPL195W 2799 nt2.18□□□□□ -2.06
SPB1P25582 TEN1YLR010C 483 nt2.18□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YNL324WYNL324W 396 nt2.18□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YPR039WYPR039W 336 nt2.18□□□□□ -2.06
SPB1P25582 VPS52YDR484W 1926 nt2.18□□□□□ -2.06
SPB1P25582 BFA1YJR053W 1725 nt2.17□□□□□ -2.06
SPB1P25582 CDC50YCR094W 1176 nt2.17□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YDL041WYDL041W 354 nt2.17□□□□□ -2.06
SPB1P25582 NOP10YHR072W-A 177 nt2.17□□□□□ -2.06
SPB1P25582 NBL1YHR199C-A 222 nt2.17□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YKL063CYKL063C 504 nt2.17□□□□□ -2.06
SPB1P25582 COX7YMR256C 183 nt2.17□□□□□ -2.06
SPB1P25582 IRC10YOL015W 1761 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 VPH1YOR270C 2523 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 RUD3YOR216C 1455 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 TOR2YKL203C 7425 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 SMD1YGR074W 441 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 VPS8YAL002W 3825 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 snR13snR13 124 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 YMR045CYMR045C 5268 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 ELG1YOR144C 2376 nt2.16□□□□□ -2.06
SPB1P25582 GDS1YOR355W 1569 nt2.15□□□□□ -2.06
SPB1P25582 NUP170YBL079W 4509 nt2.15□□□□□ -2.06
SPB1P25582 KAP123YER110C 3342 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 ATP17YDR377W 306 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 YGR025WYGR025W 303 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 MSL1YIR009W 336 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 SNC1YAL030W 354 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 YLR101CYLR101C 396 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 YMR324CYMR324C 243 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 SAP190YKR028W 3102 nt2.15□□□□□ -2.07
SPB1P25582 RTT101YJL047C 2529 nt2.14□□□□□ -2.07
SPB1P25582 YGR042WYGR042W 816 nt2.14□□□□□ -2.07
SPB1P25582 RRF1YHR038W 693 nt2.14□□□□□ -2.07
SPB1P25582 MET18YIL128W 3099 nt2.14□□□□□ -2.07
SPB1P25582 TRL1YJL087C 2484 nt2.14□□□□□ -2.07
SPB1P25582 SOK2YMR016C 2358 nt2.14□□□□□ -2.07
SPB1P25582 UFD4YKL010C 4452 nt2.13□□□□□ -2.07
SPB1P25582 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.13□□□□□ -2.07
SPB1P25582 VTC1YER072W 390 nt2.13□□□□□ -2.07
SPB1P25582 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.13□□□□□ -2.07
SPB1P25582 DGR1YNL130C-A 147 nt2.13□□□□□ -2.07
SPB1P25582 YBL108WYBL108W 306 nt2.13□□□□□ -2.07
SPB1P25582 CDC53YDL132W 2448 nt2.13□□□□□ -2.07
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