Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms