Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AMY2BP19961 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMY2BP19961 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms