Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ESRRAP11474 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms