Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC175P0C221 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC175P0C221 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms