Protein–RNA interactions for Protein: P09564

CD7, T-cell antigen CD7, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD7P09564 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD7P09564 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD7P09564 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD7P09564 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD7P09564 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD7P09564 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD7P09564 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD7P09564 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms