Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPBP07199 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPBP07199 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPBP07199 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPBP07199 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPBP07199 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPBP07199 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPBP07199 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPBP07199 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPBP07199 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPBP07199 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPBP07199 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPBP07199 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPBP07199 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CENPBP07199 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPBP07199 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms