Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL2A1P02458 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL2A1P02458 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms