Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEBLO76041 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEBLO76041 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEBLO76041 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEBLO76041 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEBLO76041 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEBLO76041 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEBLO76041 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEBLO76041 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms