Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTIFO43310 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTIFO43310 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTIFO43310 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTIFO43310 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTIFO43310 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTIFO43310 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTIFO43310 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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