Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PHOX2AO14813 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms